在轨道交通方面，南通要建设长三角北翼铁路枢纽，加快推进沪通铁路、宁启铁路二期、盐通铁路等项目建设，力促开工建设通苏嘉城际铁路，加快京沪二通道、北沿江高铁、上海-南通跨江通道、洋吕铁路及通州湾疏港铁路等项目前期工作；推进城市轨道交通建设，开工建设轨道交通1号线，启动轨道2号线，开展南通至如东、南通至通州湾城际铁路等项目的方案研究和规划；积极推动上海轨道交通延伸至南通。构建江海河联运体系，积极对接长江南京以下江海联运港区建设，争取江海联运示范港区试点。
在航空产业方面，优化航线网络布局，力争国内外通航城市增加到42个，每天客运航班增加到40班，旅客吞吐量进入全省前三。加快通州湾通用航空产业园建设，依托部省合作救助基地项目，大力发展通用航空产业，努力创建国家通用航空产业集聚示范区。加快航空物流发展，货邮吞吐量达到10万吨，打造“长三角北翼第一航空物流基地”，稳固全省前三甲地位。
