11月21日，香港特别行政区政府运输及房屋局发布新闻稿表示，自港珠澳大桥主桥动工以来，受人工与材料价格上涨、设计与施工方案调整等因素影响，主桥超支约100亿元人民币，预计超支所致额外资本将部分由三地共同承担，其余由港珠澳大桥管理局向银行借贷。相关预算调整报告已上报国务院。
该局表示，港珠澳大桥主体工程进度良好，到目前为止，大桥主桥的桥梁及海底隧道段已经贯通，现正进行隧道内部及路面的装修工程、人工岛上的建筑物装修、道路工程及交通工程等。
大桥主桥的建造费用方面，因位于内地水域的主桥自动工以来，受人工与材料价格上涨、设计与施工方案调整等因素影响，造成建设成本增加；因此项目承建商向港珠澳大桥管理局提出预算调整的申请。
“大桥管理局完成审查承建商提供的预算调整申请资料，并编制概算调整报告后，内地相关部门已把该预算调整报告上报国务院。”该局在新闻稿中称，“据了解，主桥超支约100亿元人民币。”
该局还表示，港珠澳大桥主桥立项时，三方同意所需的建造费用由三地共同承担及由港珠澳大桥管理局向银行借贷。预计主桥超支所引致的额外资本金需求将按上述立项时所订定的原则处理，亦即部分由三地共同承担而其余部分由港珠澳大桥管理局向银行借贷。具体安排，包括港方所承担的数目，特区运输及房屋局会在主桥超支幅度获得确认后向特区立法会汇报，并寻求增拨所需款项。
港珠澳大桥跨越伶仃洋，东接香港特别行政区，西接澳门特别行政区和广东省珠海市，由粤港澳三方政府共同建设、连接粤港澳三地的大型交通基础设施。整个大桥项目主要分为两部分：即主桥工程以及由粤港澳三地政府各自负责的连接路及口岸工程。
最初港珠澳大桥计划总投资约381亿元人民币，其中内地出资70亿元，香港出资67.5亿元，澳门出资19.8亿元，三地资金合计157.3亿元人民币，占主体建设费用约42%，其余通过银行贷款解决。
开通日期方面，该局称，三地同意全力以赴，克服困难及挑战，在2017年底实现大桥及口岸主要建设工程完工目标，并继续加紧完善口岸通关条件，报请中央专责小组确定大桥开通的时间，有定案后将尽快公布。
